AAV（腺相關病毒, adeno-associated virus）的基因組是一個單鏈DNA（ssDNA），全長大約?4.7 kb，整體結構比較緊湊。

一、野生型 AAV 基因組的基本結構

通常可以概括為：ITR – rep – cap – ITR

1.?ITR（inverted terminal repeats，反向末端重復序列）

位于基因組兩端

每端大約?145 nt

是 AAV 基因組中最關鍵的順式作用元件

作用包括：

• DNA復制起始
• 基因組包裝
• 病毒拯救與整合相關過程

ITR 能形成發卡結構（hairpin），這對 AAV 的復制非常重要。

2.?rep 基因

編碼復制相關蛋白

主要產生 4 種蛋白：

• Rep78
• Rep68
• Rep52
• Rep40

主要功能：

• 調控病毒復制
• 調控轉錄
• 參與基因組包裝
• 在某些情況下參與基因組整合

3.?cap 基因

編碼衣殼蛋白

主要產生：

• VP1
• VP2
• VP3

這三種蛋白共同組成病毒衣殼

此外 cap 區域還可編碼一些輔助蛋白，如AAP（assembly-activating protein），參與衣殼裝配

二、重組 AAV（rAAV）載體的基因組結構

在基因治療里，常用的不是野生型 AAV，而是重組AAV載體。它的結構通常是：ITR – 啟動子 – 目的基因 – polyA – ITR

也就是：

• 兩端保留?ITR
• 中間的?rep?和?cap?被去掉
• 替換成你想表達的外源基因表達盒

特點

• ITR 是必須保留的
• rep/cap 不在載體基因組里，而是在包裝時由輔助質粒提供
• AAV 的包裝容量有限，一般約?4.7 kb，實際常建議外源表達盒控制在?4.4–4.8 kb?左右

三、簡單示意圖

野生型 AAV

重組 AAV 載體